感染、免疫与自噬之间的关系，细胞稳态和应激反应通路，近十年来是一个发展迅速的研究领域。虽然一些细胞过程是促进感染，一些是抗感染的，但自噬已被证明既是先天免疫反应对抗微生物的组成部分，同时也是一些病原体为促进自己的复制而破坏的细胞途径。
　　《自噬、感染与免疫反应》为细胞自噬在微生物感染中的作用提供了一个统一的描述。前言从细胞角度描述了自噬通路并列举了可用于检测自噬的方法。随后的章节讨论了病毒与自噬机制的相互作用，自噬在寄生感染过程中的各种作用以及细菌与自噬途径的相互作用。结论部分探讨自噬与全身免疫反应的关系，包括抗原呈递、内质网应激和干扰素γ的产生。
　　《自噬、感染与免疫反应》是为启动自噬与感染或免疫关系方面的研究而设计的。它结合了先进的实用性技术，并概述了病原体与自噬通路之间的各种已知的相互作用。

第一章 自噬与免疫
1．1 前言
1．2 自噬
1．2．1 自噬的类型
1．2．2 形态学
1．2．3 分子机制
1．2．4 生理功能
1．3 自噬和免疫
1．3．1 异自噬：细胞内微生物的自噬性清除
1．3．2 自噬和隐肽
1．3．3 自噬与模式识别受体（pattern recognition receptors，PRRs）
1．3．4 自噬与MHC抗原递呈
1．3．5 免疫信号分子的自噬调节
1．3．6 自噬、炎症和自身免疫
1．4 结论

第二章 自噬的研究技术
2．1 前言
2．2 研究自噬的试剂和工具
2．2．1 检测LC3-Ⅱ溶酶体流的试剂
2．2．2 自噬诱导剂
2．2．3 用于抑制自噬的试剂及重组工具
2．3 免疫印记方法检测LC3-I和LC3-Ⅱ
2．4 免疫荧光方法分析内源性LC3
2．5 利用带荧光标签的LC3检测自噬
2．6 使用电镜对自噬小体及自噬溶酶体进行形态学分析
2．6．1 试剂或储备溶液
2．6．2 细胞颗粒及微生物的树脂包埋
2．6．3 对生长在玻璃瓶和塑料盖玻片上的细胞进行平面嵌入
2．7 免疫电镜技术

第三章 自噬对体内DNA病毒感染的作用
3．1 概述
3．2 在植物和无脊椎动物体内自噬与DNA病毒的相互作用
3．3 在脊椎动物体内自噬与DNA病毒的相互作用
3．3．1 自噬是一种必要的抗病毒机制，能保护机体不感染：HSV
3．3．2 自噬与HBV在体内的相互作用：病毒利用和肿瘤抑制之间的平衡
3．3．3 自噬可能抑制7-疱疹病毒的持续感染
3．4 结论

第四章 RNA病毒与体内自噬的研究
4．1 简介
4．2 植物及无脊椎动物体内RNA病毒与自噬的相互作用
4．2．1 植物
4．2．2 无脊椎动物
4．3 脊椎动物体内自噬与RNA病毒之间的相互作用
4．3．1 披膜病毒科
4．3．2 杯状病毒科
4．3．3 正黏病毒科
4．3．4 黄病毒科
4．3．5 小RNA病毒科
4．4 结论

第五章 自噬与小RNA